Facturation électronique en 2026 : ce que cela change pour votre expert-comptable et vos honoraires

La facturation électronique entre en application depuis le 1er septembre 2026 : à cette date, toutes les entreprises assujetties à la TVA établies en France doivent être en mesure de recevoir des factures électroniques, et les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire doivent commencer à en émettre. Pour les petites et moyennes entreprises et les microentreprises, l'obligation d'émettre est prévue à partir du 1er septembre 2027. Cette réforme modifie le circuit des factures et donc le travail de votre expert-comptable. Voici ce qu'il faut retenir, et comment en parler à votre cabinet.

Ce que la réforme prévoit

Jusqu'à présent, une facture entre entreprises pouvait circuler sous forme de PDF par courriel ou de papier. Le nouveau dispositif impose, pour les opérations entre assujettis à la TVA établis en France, l'échange de factures dans des formats structurés (par exemple Factur-X, UBL ou CII) via une plateforme de dématérialisation partenaire, désormais appelée plateforme agréée. Cette plateforme transmet les factures au destinataire et les données utiles à l'administration fiscale.

Deux obligations coexistent :

• la facturation électronique (e-invoicing) pour les opérations entre entreprises assujetties établies en France ;
• la transmission de données de transaction et de paiement à l'administration (e-reporting) pour les opérations qui ne relèvent pas du e-invoicing, par exemple certaines ventes à des particuliers ou à l'étranger.

Calendrier d'application

La qualification de PME, ETI ou grande entreprise obéit à des critères d'effectif, de chiffre d'affaires et de total de bilan fixés par la réglementation. Si votre entreprise appartient à un groupe, les critères peuvent s'apprécier au niveau du groupe. Vérifiez votre catégorie sur le site officiel.

L'impact concret sur le travail d'un expert-comptable

1. Réception des factures fournisseurs : elles arriveront via votre plateforme agréée. Le cabinet devra savoir comment les récupérer automatiquement pour la saisie ou le contrôle.
2. Émission des factures de vente : votre logiciel de facturation devra produire les formats attendus ou être connecté à une plateforme.
3. Contrôle de cohérence : le cabinet pourra rapprocher plus facilement factures, paiements et déclarations de TVA, ce qui peut réduire la saisie manuelle.
4. Accompagnement : choix de la plateforme, paramétrage, formation des équipes. C'est un nouveau service que les cabinets peuvent facturer.

Pour beaucoup de TPE, la réforme peut à terme réduire le temps de saisie. En attendant, les cabinets investissent dans la mise en place, ce qui peut se traduire par une nouvelle ligne de facturation.

Ce que cela peut changer sur votre devis

Questions à poser à votre cabinet :

• Propose-t-il une plateforme agréée ou un partenariat avec l'une d'elles ?
• L'accompagnement à la mise en conformité est-il inclus dans l'abonnement ou facturé séparément ?
• Comment les factures reçues sont-elles intégrées à la comptabilité ?
• Qui paramètre votre logiciel de facturation ?
• Quel est le coût éventuel de la plateforme elle-même, distinct des honoraires ?

Exemple chiffré (illustratif). Un cabinet facture 150 euros HT d'accompagnement ponctuel pour paramétrer une plateforme, puis 10 euros HT par mois pour la connexion de flux. Sur la première année : 150 + 12 x 10 = 270 euros HT. Ces montants sont des hypothèses pour illustrer le calcul. Ils ne correspondent à aucun tarif réel.

Comment se préparer, étape par étape

1. Identifiez votre catégorie d'entreprise et vos échéances.
2. Listez vos outils : logiciel de facturation, de caisse, de comptabilité.
3. Demandez à votre éditeur si son logiciel est compatible ou connecté à une plateforme agréée.
4. Choisissez une plateforme avec votre cabinet et testez-la sur quelques factures.
5. Vérifiez vos mentions de facture : les nouvelles mentions obligatoires (par exemple le numéro SIREN du client, l'adresse de livraison si elle diffère, la catégorie d'opération) sont intégrées au dispositif ; consultez la liste officielle.
6. Formez les personnes qui émettent ou reçoivent les factures.

Les erreurs à éviter

• Croire que l'envoi d'un PDF par courriel suffira durablement entre entreprises assujetties.
• Attendre la dernière échéance pour choisir une plateforme.
• Oublier les factures reçues : même une microentreprise doit pouvoir les recevoir depuis septembre 2026.
• Négliger les annuaires : l'adresse de facturation électronique de vos clients se gère dans un annuaire central.
• Ne pas conserver les factures selon les règles légales.

Quand consulter un professionnel

Si votre activité mêle ventes à des professionnels, à des particuliers et à l'étranger, ou si vous utilisez plusieurs logiciels, un expert-comptable ou un éditeur de logiciel peut cartographier vos flux et les obligations applicables. Pour toute incertitude sur une date ou une exemption, appuyez-vous sur l'administration fiscale.

Questions fréquentes

Suis-je concerné si je suis micro-entrepreneur ?

Si vous êtes assujetti à la TVA ou réalisez des opérations avec des assujettis, l'obligation de réception vous concerne. Les microentreprises en franchise de TVA peuvent relever de règles particulières : vérifiez sur le site officiel.

Mon comptable doit-il me fournir une plateforme ?

Pas nécessairement. C'est un choix de cabinet. Demandez s'il est partenaire d'une plateforme et à quelles conditions.

Que se passe-t-il si je ne respecte pas l'obligation ?

Des amendes sont prévues par les textes en cas de manquement. Consultez les barèmes officiels plutôt que des chiffres relayés sur des sites tiers.

La réforme concerne-t-elle les factures aux particuliers ?

Elles relèvent principalement du e-reporting, non de l'e-invoicing. Les modalités dépendent du type d'opération.

Sources officielles

• impots.gouv.fr — page dédiée à la facturation électronique, calendrier et liste des plateformes agréées
• Service-Public Entreprendre — fiches pratiques
• Conseil supérieur de l'Ordre des experts-comptables — ressources pour les cabinets